2種類の生物がどれくらい系統的に近いか遠いかといった情報は,生物の分類をWikipediaで確認したり系統樹を眺めたりと色々と確認する方法があるが,ではどれくらい前に2種類の生物が分岐したかという情報は意外と確認するのが難しい.そういった分岐年代を簡単に確認,比較することができるのがTimeTreeというサイトだ.

TimeTree :: The Timescale of Life

生物種を入力する

TimeTreeウェブサイトの左上にある検索ボックスに,分岐年代を辿りたい生物種を入力する.通常はCanis lupusFelis catusのような学名を入力するのだけれども,一般的な名称であるdogやcatも自動で変換してくれるようだ.もし学名がハッキリ分かっているのなら,そちらを入力したほうが確実だろう.

結果

今回のような検索クエリを入力した結果,イヌ(Canis lupus familiaris)とネコ(Felis catus)の分岐年代は55.1 Million Years Agoと推定された.ただしこの値というのは,様々な分岐年代の研究に関してイヌとネコが当てはまるものを複数集めてきて,最終的に平均を取った値となっている.個別の研究の推定結果というのは,図の左側の時系列の箇所に黒の点で表示されているように,実際には42Myaから67Myaまで幅があるようだ.このように複数のソースから分岐年代を確認できるのもTimeTreeの大きな特徴となっている.

上図の黒の点で示した個別の研究というのは,下のリストからそれぞれ確認することができる.Taxon Aがイヌ,Taxon Bがネコの検索クエリにそれぞれ対応しており,研究によってはイヌ亜目Caniformiaやネコ亜目Feliformiaのような目レベルで確認されているものや,クマ科Ursidaeやアザラシ科Phocidaeといった少し系統的に離れた分類群との比較も列挙されている(クマやアザラシはどちらもネコ目).

このように,ウェブページに表示されているリストから詳細なページに飛ぶことができるほか,「Molecular Time Estimates」にある「Download as CSV」をクリックすると,根拠となる論文や出版年のリストをコンマ区切りテキストとしてダウンロードすることができる.

参考